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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
29/12/2014 |
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Data da última atualização: |
07/04/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BENCKE-MALATO, M.; CABREIRA, C.; WIEBKE-STROHM, B.; BÜCKER-NETO, L.; MANCINI, E.; OSORIO, M. B.; HOMRICH, M. S.; TURCHETTO-ZOLET, A. C.; CARVALHO, M. C. C. G. de; STOLF, R.; WEBER, R. L. M.; WESTERGAARD, G.; CASTAGNARO, A. P.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; MARGIS-PINHEIRO, M.; BODANESE-ZANETTINI, M. H. |
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Afiliação: |
MARTA BENCKE-MALATO, UFRGS; CAROLINE CABREIRA, UFRGS; BEATRIZ WIEBKE-STROHM, UFRGS; LAURO BÜCKER-NETO, UFRGS; ESTEFANIA MANCINI, Instituto de Agrobiotecnologia Rosario SA; MARINA B. OSORIO, UFRGS; MILENA S. HOMRICH, UFRGS; ANDREIA CARINA TURCHETTO-ZOLET, UFRGS; MAYRA C. C. G. DE CARVALHO, CNPSO - estagiária; RENATA STOLF, CNPSO - estagiària; RICARDO L. M. WEBER, UFRGS; GASTÓN WESTERGAARD, Instituto de Agrobiotecnologia Rosario SA; ATÍLIO P. CASTAGNARO, Estación Experimental Agroindustrial Obispo Colombres (EEAOC); RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; FRANCISMAR CORREA MARCELINO-GUIMARÃES, CNPSO; MÁRCIA MARGIS-PINHEIRO, UFRGS; MARIA HELENA BODANESE-ZANETTINI, UFRGS. |
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Título: |
Genome-wide annotation of the soybean WRKY family and functional characterization of genes involved in response to Phakopsora pachyrhizi infection. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Plant Biology, v. 14, n. 1, article 236, Sept. 2014. |
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Páginas: |
18 p. |
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ISSN: |
1471-2229 |
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DOI: |
10.1186/s12870-014-0236-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Background: Many previous studies have shown that soybean WRKY transcription factors are involved in the plant response to biotic and abiotic stresses. Phakopsora pachyrhizi is the causal agent of Asian Soybean Rust, one of the most important soybean diseases. There are evidences that WRKYs are involved in the resistance of some soybean genotypes against that fungus. The number of WRKY genes already annotated in soybean genome was underrepresented. In the present study, a genome-wide annotation of the soybean WRKY family was carried out and members involved in the response to P. pachyrhizi were identified. Results: As a result of a soybean genomic databases search, 182 WRKY-encoding genes were annotated and 33 putative pseudogenes identified. Genes involved in the response to P. pachyrhizi infection were identified using superSAGE, RNA-Seq of microdissected lesions and microarray experiments. Seventy-five genes were differentially expressed during fungal infection. The expression of eight WRKY genes was validated by RT-qPCR. The expression of these genes in a resistant genotype was earlier and/or stronger compared with a susceptible genotype in response to P. pachyrhizi infection. Soybean somatic embryos were transformed in order to overexpress or silence WRKY genes. Embryos overexpressing a WRKY gene were obtained, but they were unable to convert into plants. When infected with P. pachyrhizi, the leaves of the silenced transgenic line showed a higher number of lesions than the wild-type plants. Conclusions: The present study reports a genome-wide annotation of soybean WRKY family. The participation of some members in response to P. pachyrhizi infection was demonstrated. The results contribute to the elucidation of gene function and suggest the manipulation of WRKYs as a strategy to increase fungal resistance in soybean plants. MenosBackground: Many previous studies have shown that soybean WRKY transcription factors are involved in the plant response to biotic and abiotic stresses. Phakopsora pachyrhizi is the causal agent of Asian Soybean Rust, one of the most important soybean diseases. There are evidences that WRKYs are involved in the resistance of some soybean genotypes against that fungus. The number of WRKY genes already annotated in soybean genome was underrepresented. In the present study, a genome-wide annotation of the soybean WRKY family was carried out and members involved in the response to P. pachyrhizi were identified. Results: As a result of a soybean genomic databases search, 182 WRKY-encoding genes were annotated and 33 putative pseudogenes identified. Genes involved in the response to P. pachyrhizi infection were identified using superSAGE, RNA-Seq of microdissected lesions and microarray experiments. Seventy-five genes were differentially expressed during fungal infection. The expression of eight WRKY genes was validated by RT-qPCR. The expression of these genes in a resistant genotype was earlier and/or stronger compared with a susceptible genotype in response to P. pachyrhizi infection. Soybean somatic embryos were transformed in order to overexpress or silence WRKY genes. Embryos overexpressing a WRKY gene were obtained, but they were unable to convert into plants. When infected with P. pachyrhizi, the leaves of the silenced transgenic line showed a higher number of lesions than ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/114583/1/Genome-wide-annotation-of-the-soybean-WRKY-family-and-functional-characterization-of-genes-involved-in-response-to-Phakopsora-pachyrhizi-infection.pdf
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 320 | |
| 301. |  | SOARES, F. X. S.; SILVA, C. M. da; ROCHA, T. L.; MARCELINO, L. H.; CARNEIRO, M.; GANDER, E. S.; SAMPAIO, M. J. A. M.; CASTRO, L. A. B. de; NESHICH, G. Theoretical model of the secondary and tertiary structure of Brazil nut 2s storage albumins. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON CRYSTALLOGRAPHY AND MOLECULAR BIOLOGY, 1990, GUARUJA, SP. Abstracts.[S.l.]: Institute of Advanced Studies, Sao Carlos: Universidade Federal de Sao Carlos, 1990. PS1-02.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 302. | | BARROS, L. M. G.; SANTOS, D. B. M.; TEIXEIRA, R. P.; ABREU, M. S.; COTTA, M. G.; DA SILVA; F. R.; KALAOUN, S.; FERREIRA, M. A.; CARNEIRO, M.; DE ALMEIDA, J. D. Validação de ESTs tecido-específicas identificadas no banco de dados do genoma funcional de Coffea spp. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 11., 2007, Gramado, RS. Fotossíntese: a essência da vida: [Resumos...]. Pelotas, RS: SBFV, 2007. Publicado também em: Brazilian Journal of Plant Physiology, v. 19, supl., 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 303. | | COSTA, M. R. G. F.; CARNEIRO, M. S. de S.; PEREIRA, E. S.; MAGALHAES, J. A.; COSTA, N. de L.; MOCHEL FILHO, W. de J. E.; BEZERRA, A. P. A. Utilização do feno de forrageiras lenhosas nativas do Nordeste brasileiro na alimentação de ovinos e caprinos. PUBVET, Londrina, v. 5, n. 7, Ed. 154, Art. 1035, 2011. 17 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Roraima. |
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| 304. | | CARVALHO, G. M. C.; LIMA NETO, A. F.; FROTA, M. N. L. da; SOUSA, V. R. de; CARNEIRO, M. S. de S.; VÉRAS, G. M. C.; COSTA, R. N. M.; AZEVEDO, D. M. M. R. O uso de bovinos Curraleiro Pé-duro em cruzamentos para produção de carne de boa qualidade no trópico quente - Fase 1. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 10., 2015, Teresina. [Anais...]. Teresina: Sociedade Nordestina de Produção Animal, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 305. | | SANTOS, M. F. A. dos; FURLANETTO, C.; ALMEIDA, M. R. A.; CARNEIRO, M. D. G.; MOTA, F. C.; GOMES, A. C. M. M.; SILVEIRA, N. O. R.; SILVA, J. G. P.; CASTAGNONE-SERENO, P.; TIGANO, M. S.; CARNEIRO, R. M. D. G. Biometrical, biological, biochemical and molecular characteristics of Meloidogyne incognita isolates and related species. European Journal of Plant Pathology, v. 134, p. 671-684, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 306. | | FERREIRA, L. G.; TELES, F. L.; DAVI, G. S.; SILVEIRA, C. R. F.; SANTOS JÚNIOR, A. C. M.; SILVANO, G. S.; NOBREGA, C. C.; BUSO, G. S. C.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BASSINELLO, P. Z.; CARNEIRO, M. S.; SILBOV, S. T. Identificação de polimorfismo em marcadores RAPD para construção de mapa genético em feijoeiro comum visando a identificação de QTLS relacionado ao teor de proteína. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1221.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 307. | | SILVA, L. L. de M. M.; COSTA, P. da; WADT, L. H. de O.; PAPPAS, M. de C. R.; CAMPOS, T. de; CARNEIRO, M. G.; SILVA, K. E. da; HOOGERHEIDE, E. S. S.; BALDONI, A. B.; SCOLES, R.; MARTORANO, L. G.; THOMAS, E.; KIMURA, R. K.; MARTINS, D. Genetic structure of Bertholletia excelsa throughout the Brazilian Amazon region. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 506. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 308. | | SILVA, L. L. de M. M.; COSTA, P. da; WADT, L. H. de O.; PAPPAS, M. de C. R.; CAMPOS, T. de; CARNEIRO, M. G.; SILVA, K. E. da; HOOGERHEIDE, E. S. S.; BALDONI, A. B.; SCOLES, R.; MARTORANO, L. G.; THOMAS, E.; KIMURA, R. K.; MARTINS, D. Genetic structure of Bertholletia excelsa throughout the Brazilian Amazon region. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 506. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 309. | | SILVA, L. L. de M. M.; COSTA, P. da; WADT, L. H. de O.; PAPPAS, M. de C. R.; CAMPOS, T. de; CARNEIRO, M. G.; SILVA, K. E. da; HOOGERHEIDE, E. S. S.; BALDONI, A. B.; SCOLES, R.; MARTORANO, L. G.; THOMAS, E.; KIMURA, R. K.; MARTINS, D. Genetic structure of Bertholletia excelsa throughout the Brazilian Amazon region. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 506. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 310. | | MOCHEL FILHO, W. de J. E.; CARNEIRO, M. S. de S.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, E. S.; ANDRADE, A. P. de; CÂNDIDO, M. J. da D. S.; MAGALHAES, J. A.; RODRIGUES, B. H. N.; SANTOS, F. J. de S.; COSTA, N. de L. Produtividade e composição bromatológica de Panicum maximum cv. Mombaça sob irrigação e adubação azotada. Revista de Ciências Agrárias, v. 39, n. 1, p. 81-88, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 311. | | ALMEIDA, J. D. de; BARROS, L. M. G.; SANTOS, D. B. M.; COTTA, M. G.; BARBOSA, E. A.; CAÇÃO, S. B.; EIRA, M. T. S.; ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; PEREIRA, L. F. P.; DA SILVA, F. R.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; CARNEIRO, M. Prospecção de promotores tecido-específico em Café. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. 5 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Comunicado Técnico, 187).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 312. | | ALMEIDA, J. D. de; BARROS, L. M. G.; SANTOS, D. B. M.; COTTA, M. G.; BARBOSA, E. A.; CAÇÃO, S. B.; EIRA, M. T. S. da; ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; PEREIRA, L. F. P.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; CARNEIRO, M. Prospection of tissue specific promoters in coffee. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22. 2008, Campinas, São Paulo, Brazil.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 313. | | DE ALMEIDA, J. D.; BARROS, L. M. G.; SANTOS, D. B. M.; COTTA, M. G.; BARBOSA, E. D.; CAÇÃO, S. B.; EIRA, M. T. S.; ALVES, G. S. C.; VINECKY, F.; PEREIRA, L. F. P.; DA SILVA, F. R.; ANDRADE, A. C.; MARRACCINI, P.; CARNEIRO, M. Prospection of tissue specific promoters in coffee. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 22., 2008, Campinas, Brazil. Programme abstracts. Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2008. PB620. Também publicado como resumo.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 314. | | RODRIGUES JÚNIOR, C. T.; CARNEIRO, M. S. de S.; MAGALHAES, J. A.; PEREIRA, E. S.; RODRIGUES, B. H. N.; COSTA, N. de L.; PINTO, M. do S. de C.; ANDRADE, A. C.; PINTO, A. P.; FOGACA, F. H. dos S.; CASTRO, K. N. de C. Produção e composição bromatológica do capim-Marandu em diferentes épocas de diferimento e utilização. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 36, n. 3 (supl. 1), p. 2141-2154, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Roraima. |
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| 315. | | TELES, F. L.; FERREIRA, L. G.; DAVI, G. S.; SILVEIRA, C. R. F.; SANTOS JÚNIOR, A. C. M.; SILVANO, G. S.; NOBREGA, C. C.; BUSO, G. S. C.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BASSINELLO, P. Z.; CARNEIRO, M. S.; SIBOV, S. T. Seleção de marcadores RAPD para construção de mapa genético em feijoeiro comum visando a identificação de QTLs associados ao teor de fibra. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 52., 2006, Foz do Iguaçu, PR. Resumos... Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2006. p. 1240.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 316. | | TELES, F. L.; FERREIRA, L. G.; KOZLOWSKI, A. L. R.; NUNES, R. C.; SILVA, G. F. O.; SIBOV, S. T.; CARNEIRO, M. S.; BRONDANI, R. V.; BUSO, G. S. C.; BASSINELLO, P. Z.; BRONDANI, C.; MELO, L. C.; PELOSO, M. J. Seleção de microssatélites polimórficos para o mapeamento de QTLs para teor de fibra em feijão (Phaseolus vulgaris L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 583.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 317. | | TELES, F. L.; FERREIRA, L. G.; DAVI, G. dos S.; SILVEIRA, C. R.; SANTOS JÚNIOR, A.; SILVANO, G.; NÓBREGA, C.; BUSO, G. S. C.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BASSINELLO, P. Z.; SIBOV, S. T.; CARNEIRO, M. S. Mapa genético baseado em marcadores microssatélites e RAPD utilizando populações de melhoramento contrastante para teor de fibra no feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais... São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 318. | | TELES, F. L.; FERREIRA, L. G.; DAVI, G. dos S.; SILVEIRA, C. R.; SANTOS JÚNIOR, A.; SILVANO, G.; NÓBREGA, C.; BUSO, G. S. C.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C.; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BASSINELLO, P. Z.; SIBOV, S. T.; CARNEIRO, M. S. Mapa genético baseado em marcadores microssatélites e RAPD utilizando populações de melhoramento contrastante para teor de fibra no feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 4., 2007, São Lourenço. Anais... São Lourenço: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 319. | | FERREIRA, L. G.; TELES, F. L.; DAVI. G. S.; KOZLOWSKI, A. L. R.; NUNES, R. C.; BUSO, G. S. C.; BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BASSINELLO, P. Z.; SIBOV, S. T.; CARNEIRO, M. S. Utilização de marcadores microssatélites na construção de mapa genético em feijoeiro comum, visando a identificação de QTL's associados ao teor de proteínas em grãos. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 8., 2005, Goiânia. Anais... Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2005. v. 1. p. 579-581. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 182).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 320. | | GARCIA, A. A. F.; MOLLINARI, M.; MARCONI, T. G.; SERANG, O. R.; SILVA, R. R.; VIEIRA, M. L. C.; VICENTINI, R.; COSTA, E. A.; MANCINI, M. C.; GARCIA, M. O. S.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; MARTINS, E. R. F.; DAHMER, N.; SFORÇA, D. A.; SILVA, C. B. C.; BUNDOCK, P.; HENRY, R. J.; SOUZA, G. M.; SLUYS, M.-A. V.; LANDELL, M. G. A.; CARNEIRO, M. S.; VINCENTZ, M. A. G.; PINTO, L. R.; VENCOVSKY, R.; SOUZA, A. P. SNP genotyping allows an in-depth characterisation of the genome of sugarcane and other complex autopolyploids. Scientific Reports, v. 3, p. 1-10, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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